voci originali: Nolan North, Mitchell Whitfield, James Arnold Taylor, Mikey Kelley, Mako, Sarah Michelle Gellar, Chris Evans, Patrick Stewart, Zhang Ziyi, Kevin Smith, John Di Maggio, Fred Tatasciore, Kevin Michael Richardson, Laurence Fishburne

voci italiane: Stefano Crescentini, Davide Perino, Simone Crisari, Nanni Baldini, Vittorio Di Prima, Domitilla D'amico, Marco Vivio, Saverio Indrio, Perla Liberatori, Luigi Ferraro, Mario Bombardieri, Massimo Lodolo, Claudio Fattoretto, Davide Garbolino, Massimo Corvo

Il temibile nemico delle tartarughe ninja, Shredder, è morto. Leonardo è stato mandato dal maestro Splinter in America del Sud per affinare le sue qualità di leader del gruppo, mentre Donatello, Michelangelo e Raffaello sono rimasti a New York e senza il loro fratello si sentono perduti. Donatello ha aperto una società di consulenza telefonica per chi ha problemi con il computer, Michelangelo anima feste di compleanno per ragazzini nei panni di Cowabunga Carl, mentre Raffaello dorme tutto il giorno e di notte, all'insaputa dei fratelli, combatte il crimine sotto le spoglie di Nightwatcher, il guardiano della notte. Nel frattempo April e Casey hanno ottenuto un lavoro presso Maximilian Winters, un miliardario che colleziona oggetti antichi e che ha al suo servizio anche l'intero Foot Clan.